Voor spelers die de game al jaren spelen, zullen even moeten wennen. Er zijn een aantal dingen verplaatst, wat nieuwe menu’s en een duidelijke splitsing tussen de club en de selectie. Het komt er in feite op neer dat alles nu logischer te vinden is.

Adaptive Lay-out
In FM12 werkt men met en zogeheten Adaptive Lay-out. In het Nederlands wil dat zeggen dat hoe  hoger je resolutie, des te meer informatie kan je kwijt op je scherm.

Homepage
De grootste veranderingen in de lay-out zijn te vinden op de homepages van de manager. Deze bevatten nu veel meer informatie en worden ook voor veel meer doeleinden gebruikt. Clubs, Landen, Spelers en andere onderdelen in de game hebben nu een eigen homepage.

Kolommen
Evenals vorig jaar heeft FM12 de mogelijkheid je scherm aan te passen. Je kunt kolommen toe voegen en verwijderen en dus naar eigen smaak je scherm voorzien van informatie. Dit is geen vernieuwing op zich, maar het aantal kolommen is aangepast, evenals de plaatsen waar je deze aan kunt passen.

Aanpassen kleuren Spelerprofiel
In het verleden kon je al de kleuren van de eigenschappen van spelers aanpassen. Dat moest op en ingewikkelde wijze via een XML bestand. In FM12 is er de optie om dit in de game zelf aan te passen. Zo kan je dus snel en simpel de kleuren aanpassen.

Back & Forward knoppen
Je kunt nu net als in een webbrowser eenvoudiger schakelen. Tevens kan je je muisknop ingedrukt houden waarna de 25 laatste pagina’s verschijnen die je hebt bezocht. Zo kan je dus nog sneller schakelen tussen alle pagina’s.

Zoekscherm
Een grote aanpassing in de interface is de manier bij het zoeken naar spelers. In de voorgaande FM’s moest je handmatig de filters aan te passen door op een knopje te klikken en vervolgens in een ander scherm weer de filters in te stellen. Dit is niet meer nodig. Je hebt nu de mogelijkheid om filters direct aan te passen zonder eerst een ander scherm te gebruiken. Tevens zijn er een aantal voorgeprogrammeerde filters voor je gemaakt. Zo kan je snel zien welke spelers op de transferlijst staan of alle spelers zonder contract.